با سقوط حکومت پیشین و روی کار آمدن امارت اسلامی شمار زیادی از مردم افغانستان به کشورهای دیگر، به ویژه ایران وپاکستان مهاجر شدند.
رسانه‌های پاکستانی گزارش داده‌اند که اسحاق دار معاون نخست‌وزیر پاکستان،با دونالد بلوم سفیر امریکا دیدار و در مورد موضوع های دو جانبه و منطقه‌ای از جمله حفاظت از پناهجویان افغان، همکاری‌های اقتصادی، امنیت و مبارزه با هراس افگنی گفت‌وگو کرده‌اند.
درهمین حال، برخی از آگاهان سیاسی بحث امریکا و پاکستان در مورد حل مشکل مهاجران افغان را بی فایده دانسته و می‌ا‌فزایند که پاکستان برای مسایل جدید منطقه از امریکا هدایت می‌گیرد.
براساس آمار قنسل‌گری امارت اسلامی در کراچی بیش از یک سال گذشته که بیش از۳۲۵۰ پناه‌جوی افغان مشمول زنان و کودکان در بازداشتگاه‌های ایالت سند در بند بودند، آزاد و به افغانستان منتقل شده‌اند.
